در دوره پهلوی، با وجود برخی اقدامات عمرانی، تخت فولاد با چالش‌ها و آسیب‌هایی نیز مواجه بود.

تکایای جدید

در این دوره، تکایای جدیدی توسط خیرین بر سر مزار علما و بزرگان در تخت فولاد احداث شد. از جمله این تکایا می‌توان به موارد زیر اشاره کرد:

• تکیه آقا سید محمد لطیف خواجویی
• تکیه زرگرها
• تکیه سید العراقین
• تکیه امام جمعه
• تکیه آقا باقر قزوینی
• تکیه ایزدگشسب
• تکیه بروجردی
• تکیه حجت نجفی
• تکیه گلزار
• تکیه مقدس

تکمیل ظرفیت و مشکلات

در اواخر حکومت پهلوی، ظرفیت گورستان تخت فولاد تکمیل شده و جایی برای دفن اموات جدید در این شهر پرجمعیت وجود نداشت.

علاوه بر این، احداث فرودگاه اصفهان در اراضی جنوب تخت فولاد و احداث خیابان‌های سعادت آباد و فیض، موجب گسستگی بافت تاریخی این گورستان شد.

ساخت و ساز در محدوده تخت فولاد

از دیگر آسیب‌های تخت فولاد در عهد پهلوی، ساخت و ساز در محدوده این گورستان و نواحی پیرامون آن بود. با گسترش شهر به ویژه به سمت جنوب، قسمت‌هایی از اراضی تخت فولاد به کاربری‌های دیگری مانند محله‌های مسکونی و مراکز دولتی مانند مدارس، مراکز درمانی و بهزیستی، بانک‌ها و ... تبدیل شد. این ساخت و سازها بر روی زمین‌های کشاورزی و بقاذای باغ‌ها و عمارات عصر صفوی احداث شدند.

در جریان توسعه مناطق مسکونی در درون بافت تاریخی تخت فولاد، تخریب و تصرف قبرستان‌ها و تکایای این گورستان نیز سرعت بیشتری گرفت که عمدتاً با بی‌تفاوتی مقامات دولتی بویژه شهرداری وقت همراه بود.

ممنوعیت دفن در قبرستان‌های شهر

در دوره سلطنت رضاشاه، دفن اموات در قبرستان‌های شهر ممنوع شد و کلیه قبرستان‌های داخل شهر تسطیح و تخریب شده و تخت فولاد به عنوان تنها گورستان شهر مورد استفاده قرار گرفت. به همین دلیل بسیاری از تکایا مملو از قبور شد و زمین‌های کشاورزی و بایر نیز به گورستان و تکیه تبدیل شدند.

دفن شهدای انقلاب

از آخرین وقایع مهم تخت فولاد در این دوران، دفن شهدای انقلاب در این گورستان، به ویژه در نزدیکی لسان الارض بود. این شهدا کسانی بودند که علیه رژیم پهلوی دست به مبارزه زده و به دست ماموران رژیم به شهادت رسیده بودند.